第一节 分类

分类学中的分类等级由高到低分为：界（kingdom）、门（phylum）、纲（class）、目（order）、科（family）、属（genus）和种（species）。种是微生物分类的基本单位。种以下的分类单位（如血清型和生物型等）在分类学上没有合法的分类地位。界的分类变动较大，从开始认识的动、植物两界到六界分类系统，发展为目前的三域理论。六界分类法包括病毒界（vira）、原核生物界（procaryotae）、原生生物界（protista）、真菌界（fungi）、植物界（plantae）和动物界（animalia）。支原体在分类学上属于原核生物界。随着分子生物学技术尤其是细菌“16S rRNA工程”的不断发展，人们接受了Woese提出的三原界（urkingdom）理论，即将生物分成真细菌原界（eubacteria）、古细菌原界（archaeobacteria）和真核生物原界（eucaryote）。后来人们又以“域（domain）”代替了“原界”的称谓，继而认为生物是由细菌域（bacteria）、古生菌域（archia）和真核生物域（eucaria）组成。尽管对分类单位——“域”是否能凌驾于“界”之上仍有不同的认识，但三域理论已被学者们广为接受。按目前的认识，支原体应属于细菌域。

根据双命名法原则，支原体有属名和种名。支原体的属名通常可以缩写为一个大写字母，种名则不能缩写，如肺炎支原体（Mycoplasma pneumoniae）通常写成M. pneumoniae。属名和种名是描述该种支原体一些最适特征的拉丁文或希腊文，为斜体。如支原体属（Mycoplasma）的几个种描述如下：人型支原体（M. hominis）、生殖支原体（M. genitalium）和穿透支原体（M. penetrans）。这些种的含义分别表示“人型”“生殖”和“穿透”，而且它们都是指各种支原体最主要的形态、生理或生态学特征。支原体命名的原则必须符合《国际细菌命名法则》，该法则详细说明了将新分离的支原体定名到新属或新种的规则。

当分离到一株支原体并认为它是一种新菌时，人们必须确认该菌与其他的种有明显的差异，从而可将其描述为一个新种，或者甚至与所有描述过的属有明显的差异，从而可将其描述为一个新属。为了使新属或新种获得正式的分类地位，要将分离株的描述和拟定的名称发表，并将该支原体种的纯培养物保存在公认的菌种保藏机构，通常是美国菌种保藏中心（ATCC）或德国菌种保藏中心（DSM）。保藏菌株作为新种和新属的模式菌株，并将其作为标准以供被认为与其相同的菌株进行比较。

International Journal of Systematic Bacteriology（《国际系统细菌学杂志》，IJSB）是对微生物进行分类和鉴定所发表的官方记录，若新菌株的描述发表在IJSB外的杂志上，则发表文章的复印件必须呈交IJSB，而且文中名称在被正式确认为新的分类单位之前有效。IJSB定期发表支原体名称的批准目录，该目录承认任何新名称并为其进入Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology（《伯杰氏系统细菌学手册》）做好准备，该手册纳入了原核生物主要的分类方法。

菌种保藏机构通常用冷冻或冷冻干燥的方法保存菌种，这种方法与植物或动物标本的保存方法有很大区别，后者保存的标本（死的，或干燥的植物材料，或化学固定的动物标本）作为拟定新种比较的基础。微生物学家依靠活的菌体研究其生物学性状、致病性与致病机制等。

从《伯杰氏系统细菌学手册》第二版开始，菌种的编排遵循种系发育树，大部分是基于核糖体小亚基RNA的核苷酸序列而不是根据表型数据。原核生物中具有一整套种系发育树。然而，和其他实验衍生的假设一样，种系发育树不是静止的，当出现新的数据和/或改进分析方法时，种系发育树也会做出相应的改动。因此，在分类学提纲中进行修改和赋予新的解释。

界的下一级分类单位是门，目前国际系统细菌学委员会认定的门有12个，即拟杆菌门（Bacteroidetes）、螺旋体门（Spirochaetes）、柔膜菌门（Tenericutes）、酸杆菌门（Acidobacteria）、纤维杆菌门（Fibrobacteres）、梭杆菌门（Fusobacteria）、网团菌门（Dictyoglomi）、芽单胞菌门（Gemmatimonadetes）、黏胶球形菌门（Lentisphaerae）、疣微菌门（Verrucomicrobia）、衣原体门（Chlamydiae）和浮霉菌门（Planctomycetes）。

柔膜菌门包括一个柔膜体纲，柔膜体纲包含4个目、7个科和11个属（图2-1）。4个目即：支原体目（Mycoplasmatales）、虫原体目（Entomoplasmatales）、无胆甾原体目（Acholeplasmatales）和厌氧原体目（Anaeroplasmatales）；7个科：支原体科（Mycoplasmataceae）、未定科（Incertae sedis）、虫原体科（Entomoplasmataceae）、螺原体科（Spiroplasmataceae）、无胆甾原体科（Acholeplasmataceae）、植原体科（Phytoplasmataceae）和厌氧原体科（Anaeroplasmataceae）；11个属：支原体属（Mycoplasma）、脲原体属（Ureaplasma）、红细胞体属（Eperythrozoon）、血巴尔通体属（Haemobartonella）、虫原体属（Entomoplasma）、中间原体属（Mesoplasma）、螺原体属（Spiroplasma）、无胆甾原体属（Acholeplasma）、植原体属（Phytoplasma）、厌氧原体属（Anaeroplasma）和无甾醇原体属（Asteroleplasma）。

图2-1　柔膜体纲分类